La metagenomica virale e la sicurezza del sangue

La caratterizzazione del gruppo di virus associati al sangue umano (chiamato anche blood virome) è essenziale per la sorveglianza epidemiologica e per anticipare le nuove potenziali minacce per la sicurezza delle  trasfusioni di sangue e di emocomponenti. Attualmente, il rischio di trasmissione per via  ematica dei dei virus noti (HBV, HCV, HIV e HTLV) può essere considerato sotto controllo nei paesi più sviluppati. Tuttavia, altri virus sconosciuti o insospettati possono essere trasmessi a coloro che ricevono prodotti derivati ​​dal sangue. Questo è particolarmente rilevante se si considera che una percentuale significativa di pazienti trasfusi sono immunocompromessi e  frequentemente destinati ad esiti fatali. Diverse misure per prevenire la trasmissione attraverso le trasfusioni di virus sconosciuti sono state implementate tra cui l’esclusione dei donatori a rischio, la riduzione dei leucociti del sangue del donatore, e il trattamento chimico-fisico delle diverse componenti del sangue. Tuttavia, fino ad oggi non esiste un metodo universale per l’inattivazione dei patogeni,  applicabile a tutti i tipi di componenti del sangue e, altrettanto efficace per tutte le famiglie virali. Inoltre, tra le procedure di inattivazione virale  disponibili virali, alcuni di esse sono riconosciute per essere meno efficaci sui virus non capsulati, e inadeguate per inattivare alti titoli virali  in pool di plasma o derivati. Per questo motivo vi è la necessità di implementare nuove metodologie per la scoperta di virus ignoti che possono influenzare l’uso della trasfusione di sangue e dei plasmaderivati. La metagenomica virale combinata con High Throughput Sequencing appare come un approccio promettente per l’identificazione e la sorveglianza globale di nuovi e / o imprevisti virus che potrebbero compromettere la sicurezza dell’uso del sangue e dei suoi derivati.


 

Transfus Clin Biol. 2016 Jan 8. pii: S1246-7820(15)00429-2. doi: 10.1016/j.tracli.2015.12.002. [Epub ahead of print]

Viral metagenomics and blood safety.

Sauvage V1, Eloit M2.